Последний твой абзац - это, на деле, просто наследние Unix-систем, где очень умно построена система хранения персонализированных данных. Грубо говоря - скопировал свою домашнюю директорию - получил взад все свои настройки. :) Исключений из этого правила гораздо меньше, чем виндовых программ, не держащих свои данные исключительно в registry. :)